More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0933 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0933  inner-membrane translocator  100 
 
 		 361 aa  702    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.681198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2962  putative ABC type branched chain amino acid transport system  76.75 
 
 		 361 aa  527  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.234681 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  72.3 
 
 		 360 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  72.02 
 
 		 360 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  71.19 
 
 		 360 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  70.03 
 
 		 360 aa  476  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1764  inner-membrane translocator  64.12 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382109  normal  0.473467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  52.81 
 
 		 364 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  47.5 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  49.31 
 
 		 360 aa  298  7e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  46.39 
 
 		 361 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  49.31 
 
 		 358 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  48.74 
 
 		 361 aa  289  4e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  46.67 
 
 		 361 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  47.61 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  43.02 
 
 		 355 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1133  inner-membrane translocator  46.89 
 
 		 359 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1417  inner-membrane translocator  45.83 
 
 		 364 aa  278  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017685  normal  0.100323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  46.09 
 
 		 368 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 360 aa  275  7e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  45.53 
 
 		 368 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  45.2 
 
 		 383 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  45.48 
 
 		 368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  49.16 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1484  inner-membrane translocator  45.38 
 
 		 370 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0529848 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  44.07 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  45.04 
 
 		 363 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  48.02 
 
 		 367 aa  265  8e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2446  inner-membrane translocator  45.48 
 
 		 357 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  45.89 
 
 		 363 aa  263  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  43.61 
 
 		 368 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  42.34 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  44.17 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  44.23 
 
 		 387 aa  258  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  43.66 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  46.05 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3456  inner-membrane translocator  46.28 
 
 		 361 aa  256  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0696875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  44.57 
 
 		 369 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  43.1 
 
 		 366 aa  255  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  47.16 
 
 		 363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  43.58 
 
 		 369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5004  inner-membrane translocator  46.63 
 
 		 357 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  45.21 
 
 		 369 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  43.06 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01680  putative permease of ABC transporter  44.44 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000106263  normal  0.914091 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  45.73 
 
 		 364 aa  238  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  45.43 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  41.13 
 
 		 362 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  44.82 
 
 		 363 aa  236  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  44.04 
 
 		 362 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  45.03 
 
 		 362 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1065  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 362 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 362 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0214  ABC transporter permease  43.94 
 
 		 365 aa  222  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2991  inner-membrane translocator  42.82 
 
 		 366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183315 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  39.27 
 
 		 366 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  35.2 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1458  inner-membrane translocator  35.56 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  34.02 
 
 		 365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 364 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.18 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.64 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0215  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 355 aa  176  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.900459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3236  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 354 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1792  inner-membrane translocator  34.89 
 
 		 352 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00867144  normal  0.323274 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  34.86 
 
 		 349 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  30.81 
 
 		 365 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 		 365 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5273  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.59 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  32.1 
 
 		 347 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  31.99 
 
 		 352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3307  inner-membrane translocator  30.9 
 
 		 347 aa  153  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  30.37 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  36.01 
 
 		 365 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1508  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143335  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3027  inner-membrane translocator  32.03 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.722972 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  29.03 
 
 		 391 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.39 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4621  putative ABC transporter (permease protein)  34.38 
 
 		 369 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0986028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  29.3 
 
 		 349 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  29.71 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  29.91 
 
 		 365 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 371 aa  143  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0766  inner-membrane translocator  29.23 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.286695  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  28.9 
 
 		 372 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 357 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6357  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 349 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.15152  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  32.6 
 
 		 347 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1926  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 354 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0125222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4143  inner-membrane translocator  31.21 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6178  inner-membrane translocator  29.66 
 
 		 349 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00223379  normal  0.248312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3577  inner-membrane translocator  33.24 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1003  inner-membrane translocator  31.83 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  28.87 
 
 		 377 aa  136  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  28.73 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>