More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0368 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  100 
 
 		 403 aa  816    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  84.9 
 
 		 404 aa  702    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  82.35 
 
 		 405 aa  657    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  81.98 
 
 		 405 aa  674    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  82.72 
 
 		 405 aa  686    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1307  proteasome-activating nucleotidase  64.82 
 
 		 406 aa  505  9.999999999999999e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.732234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  65.13 
 
 		 407 aa  507  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3362  26S proteasome subunit P45 family  63.04 
 
 		 410 aa  504  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  64.08 
 
 		 407 aa  503  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  64.18 
 
 		 410 aa  485  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1266  proteasome-activating nucleotidase  56.84 
 
 		 404 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0400  proteasome-activating nucleotidase  54.01 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.583588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1040  proteasome-activating nucleotidase  55.14 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.681271 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1308  proteasome-activating nucleotidase  55.74 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.114545  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1458  proteasome-activating nucleotidase  53.17 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0507  proteasome-activating nucleotidase  56.34 
 
 		 386 aa  403  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.56018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2301  proteasome-activating nucleotidase  50.8 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  50.39 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  50.13 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1024  proteasome-activating nucleotidase  49.61 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123618  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0920  proteasome-activating nucleotidase  49.35 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  49.37 
 
 		 408 aa  378  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1761  proteasome-activating nucleotidase  49.35 
 
 		 407 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  46.1 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1461  proteasome-activating nucleotidase  46.8 
 
 		 436 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.199419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0458  proteasome-activating nucleotidase  50.27 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  47.69 
 
 		 412 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1038  proteasome-activating nucleotidase  46.27 
 
 		 412 aa  361  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.372597  normal  0.687098 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  48.31 
 
 		 394 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1174  proteasome-activating nucleotidase  47.97 
 
 		 422 aa  355  5e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2113  proteasome-activating nucleotidase  46.53 
 
 		 426 aa  352  5e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.685736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0620  proteasome-activating nucleotidase  47.73 
 
 		 431 aa  348  7e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  46.6 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  45 
 
 		 393 aa  344  2e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03020  endopeptidase, putative  49.23 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71824  protease regulatory subunit 8 homolog (SUG1 protein) (CIM3 protein) (TAT-binding protein TBY1)  42.06 
 
 		 402 aa  328  8e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02213  proteasome regulatory particle subunit Rpt2, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07050)  46.22 
 
 		 460 aa  326  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0288941 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30617  predicted protein  47.38 
 
 		 443 aa  325  7e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.580577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11735  predicted protein  44.35 
 
 		 389 aa  325  9e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06988  hypothetical protein similar to proteasome p45/SUG (Broad)  44.07 
 
 		 389 aa  322  8e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.407923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54032  26S protease regulatory subunit 4 homolog (TAT-binding homolog 5)  45.85 
 
 		 434 aa  321  9.999999999999999e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0833723 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  51.9 
 
 		 398 aa  319  5e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01000  endopeptidase, putative  42.45 
 
 		 407 aa  319  6e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.174287  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  42.65 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  48.32 
 
 		 429 aa  317  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41778  predicted protein  53.16 
 
 		 284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0751976  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03930  endopeptidase, putative  43.05 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0534334  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30067  predicted protein  49.83 
 
 		 403 aa  310  2e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.657092  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01550  endopeptidase, putative  40.66 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.865518  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03550  endopeptidase, putative  49.66 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.502719  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35070  predicted protein  42.43 
 
 		 417 aa  306  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746786  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  50 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  50 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04236  hypothetical protein similar to TAT-binding protein 1 (Broad)  41.24 
 
 		 465 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.110869 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02904  proteasome regulatory particle subunit Rpt3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11390)  41.3 
 
 		 422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.211289 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  50.85 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  48.94 
 
 		 405 aa  300  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45122  predicted protein  50 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_66830  26S proteasome regulatory subunit  46.2 
 
 		 410 aa  300  4e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0000427133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  51.23 
 
 		 447 aa  299  8e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34331  predicted protein  41.18 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.926825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52887  26S proteasome regulatory subunit  49.48 
 
 		 427 aa  297  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05747  hypothetical protein similar to PSMC6 subunit (Broad)  41.37 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222803  normal  0.0253751 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85761  26S protease subunit RPT4 (26S protease subunit SUG2) (Proteasomal cap subunit)  44.13 
 
 		 416 aa  279  5e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50 
 
 		 742 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.82 
 
 		 756 aa  259  7e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.78 
 
 		 763 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.49 
 
 		 732 aa  257  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.3 
 
 		 754 aa  256  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.61 
 
 		 754 aa  255  9e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.67 
 
 		 743 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.86 
 
 		 740 aa  253  5.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.99 
 
 		 757 aa  252  7e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  51.98 
 
 		 740 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.88 
 
 		 781 aa  250  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.42 
 
 		 754 aa  249  6e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.24 
 
 		 754 aa  249  6e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  52.42 
 
 		 742 aa  248  9e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.9 
 
 		 800 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.39 
 
 		 781 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  41.4 
 
 		 730 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.85 
 
 		 806 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  50.22 
 
 		 769 aa  246  6.999999999999999e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  44.44 
 
 		 764 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  45.74 
 
 		 784 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.74 
 
 		 723 aa  245  9e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.77 
 
 		 727 aa  245  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.1 
 
 		 701 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  44.1 
 
 		 768 aa  245  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  51.53 
 
 		 763 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  47.49 
 
 		 739 aa  243  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  48.85 
 
 		 776 aa  242  7e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2427  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  47.08 
 
 		 805 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  48.03 
 
 		 775 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.09 
 
 		 718 aa  241  1e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  48.25 
 
 		 759 aa  241  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0262  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  46.9 
 
 		 810 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  46.12 
 
 		 805 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  46.39 
 
 		 754 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  51.75 
 
 		 808 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>