More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2068 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2068  UspA domain protein  100 
 
 
145 aa  294  3e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  42.96 
 
 
143 aa  110  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  41.1 
 
 
142 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  41.67 
 
 
145 aa  99.8  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  42.45 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  41.96 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  43.06 
 
 
144 aa  98.2  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  40.43 
 
 
141 aa  96.7  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  38.51 
 
 
295 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4016  UspA domain protein  37.86 
 
 
142 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2792  UspA domain protein  43.75 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  36.77 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  40.56 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  37.86 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  41.43 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  40.15 
 
 
137 aa  89.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  40.28 
 
 
138 aa  89.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  35.86 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  43.07 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0101  UspA domain protein  39.46 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3438  UspA domain protein  43.97 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  41.91 
 
 
138 aa  84  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1257  UspA domain protein  40 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  36.5 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1776  UspA domain protein  35.92 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1734  UspA domain protein  40.27 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  39.72 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1343  UspA domain protein  37.59 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292273  normal  0.588543 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  37.04 
 
 
283 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1980  UspA domain protein  38.56 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal  0.0911055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.96 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  36.81 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1120  UspA domain protein  38.3 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.295874  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  38 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1524  UspA domain protein  39.01 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0456308  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  32.87 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3822  UspA domain protein  35.06 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2057  UspA domain protein  34.51 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.612176  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  35.57 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3824  UspA domain protein  42.45 
 
 
295 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1243  UspA domain protein  33.78 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.169034 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  36.43 
 
 
301 aa  70.5  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.21 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  36.76 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.51 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  34.53 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.82 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  35.37 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  34.56 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  40.88 
 
 
281 aa  68.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  37.58 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0904  UspA domain protein  35.29 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.633765  normal  0.56793 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  35.25 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  33.33 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  34.53 
 
 
207 aa  67  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.62 
 
 
156 aa  67  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.31 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  34.07 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  31.33 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  37.41 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  37.96 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  35.62 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  32.62 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  33.81 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  35.15 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  33.58 
 
 
288 aa  64.7  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  32.65 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  36.69 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1111  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.33 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.61 
 
 
152 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  34.44 
 
 
187 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  38.24 
 
 
297 aa  64.3  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.37 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  30.99 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.07 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  32.67 
 
 
304 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  37.31 
 
 
162 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  31.72 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  31.65 
 
 
176 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  35.14 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 
297 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.34 
 
 
287 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 
150 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  32.87 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  34.72 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  34.97 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  35.25 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  34.72 
 
 
170 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  34.25 
 
 
286 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>