263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0741 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0741  ribonuclease HII  100 
 
 		 228 aa  454  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2705  ribonuclease HII  71.86 
 
 		 221 aa  318  6e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.283445  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1323  ribonuclease HII  62.28 
 
 		 210 aa  257  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.831431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0985  ribonuclease HII  56.89 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1966  ribonuclease HII  51.48 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.113979 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1488  ribonuclease HII  44.25 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00425988  normal  0.0105413 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2753  ribonuclease HII  39.22 
 
 		 224 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750748  hitchhiker  0.00109608 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1299  ribonuclease HII  34.78 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.554305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0956  ribonuclease HII  36.52 
 
 		 212 aa  140  9.999999999999999e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0780  ribonuclease HII  41.3 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1943  ribonuclease HII  40.52 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.586034 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0204  ribonuclease HII  34.35 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0499908  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0504  ribonuclease HII  40.36 
 
 		 205 aa  135  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0619  ribonuclease HII  33.04 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1216  ribonuclease HII  38.03 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0140461 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0450  ribonuclease HII  37.84 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.614438  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0684  ribonuclease HII  32.33 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.132791  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0963  ribonuclease HII  37.66 
 
 		 219 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.647368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0899  ribonuclease HII  38.01 
 
 		 213 aa  123  3e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0608  ribonuclease HII  33.33 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0245  ribonuclease HII  38.84 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.725917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1393  ribonuclease HII  31.67 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1729  ribonuclease HII  32.08 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.110653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1305  ribonuclease HII  35.62 
 
 		 195 aa  85.1  7e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.14682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0780  ribonuclease HII  33.96 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0193  ribonuclease HII  29.15 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.996917  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0661  ribonuclease HII  31.34 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000181972  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0312  ribonuclease HII  34.27 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02520  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  33.92 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  32.27 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31007  predicted protein  30.6 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.718365  normal  0.389801 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  28.37 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  31.7 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  30.45 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  28.83 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1569  ribonuclease HII  31.53 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6881  ribonuclease HII/HIII  33.18 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  32.11 
 
 		 253 aa  62  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  30.14 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32830  predicted protein  28.33 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  30.88 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  27.93 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  33.53 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  30.64 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  31.78 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1676  ribonuclease H  27.35 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.119655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  29.69 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  31.19 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  29.15 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  29.41 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1437  ribonuclease HII  31.72 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  28.1 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  27 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  29.6 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  28.49 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1850  RNase HII  32.8 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  32.56 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  29.44 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  29.85 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  30.81 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  34.34 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  29.85 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  29.5 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  29.85 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  32.56 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  29.5 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  30.81 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  30.81 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  34.34 
 
 		 229 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0521  ribonuclease HII  31.72 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  34.44 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  28.31 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  30.27 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  28.02 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2145  ribonuclease HII  31.51 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  28.02 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1335  ribonuclease HII  28.74 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1263  ribonuclease H  29.38 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  30.1 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  29.68 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  29.73 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  39.25 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  31.25 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  31.12 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  30.05 
 
 		 197 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  29.09 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  34.68 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  28.7 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  31.52 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  28.64 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  26.67 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  34.68 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0414  ribonuclease H  32.95 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0129425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  28.7 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  34.66 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3267  ribonuclease HII  35.14 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279787  normal  0.160809 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  30.11 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  29.07 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  31.02 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>