More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0553 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  66 
 
 		 203 aa  258  5.0000000000000005e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  69.39 
 
 		 201 aa  256  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  64.82 
 
 		 208 aa  247  6e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  51.02 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  48.26 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  50.26 
 
 		 202 aa  175  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  48.45 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  50.78 
 
 		 208 aa  174  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  51 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  43.84 
 
 		 205 aa  167  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  47.67 
 
 		 204 aa  166  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  51.55 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  49 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  49 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  49 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  47.47 
 
 		 215 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 205 aa  164  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  49 
 
 		 209 aa  164  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  48.74 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 203 aa  161  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  43.52 
 
 		 197 aa  160  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  45.18 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  41.15 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  44.79 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 215 aa  158  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 215 aa  157  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  47.24 
 
 		 204 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  43.3 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  45.36 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  44.27 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 215 aa  154  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  44.33 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  43.59 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 222 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  44.85 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  43.65 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  40.51 
 
 		 216 aa  152  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  44.85 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 214 aa  152  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  45.08 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  46.5 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 		 217 aa  151  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.49 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  43.08 
 
 		 200 aa  150  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  46.38 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1822  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.295003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1857  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  43.39 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  38.83 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  39.49 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  39.49 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  42.53 
 
 		 227 aa  148  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 251 aa  147  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 215 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 219 aa  147  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 		 217 aa  147  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  42.49 
 
 		 194 aa  146  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  45.54 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  47.59 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 224 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 238 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  47.72 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 209 aa  145  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  43.08 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  41.26 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  44.39 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  41.75 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 220 aa  144  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 230 aa  144  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 220 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  38.34 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>