102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1930 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1930  UspA domain protein  100 
 
 		 149 aa  286  6e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.110845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1304  UspA domain protein  58.62 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.708291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3428  UspA domain protein  55.86 
 
 		 153 aa  142  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0223  UspA domain protein  51.33 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.189341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0966  UspA domain protein  48.65 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  35.29 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  31.45 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  31.01 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  32.45 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  33.33 
 
 		 283 aa  54.7  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30.14 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  32.67 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  29.37 
 
 		 286 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  30.56 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  30.77 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1664  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  29.17 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  27.61 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  29.05 
 
 		 290 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  27.78 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.28 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.34 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1272  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.828897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  30.46 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  31.47 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0081  UspA domain protein  26.49 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324283  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  26.24 
 
 		 207 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  31.29 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  29.37 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  31.94 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  27.21 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  28.97 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  28.77 
 
 		 297 aa  45.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  29.08 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  31.37 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  25.52 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  27.4 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  35.14 
 
 		 280 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  28.28 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  27.59 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  28.28 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  31.47 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  31.97 
 
 		 141 aa  44.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0351  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  31.97 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28.86 
 
 		 307 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  27.46 
 
 		 208 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  25.52 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1768  UspA domain-containing protein  26.39 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  28.29 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  29.25 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  28.93 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  27.27 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  29.25 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  32.64 
 
 		 288 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  25.87 
 
 		 294 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  27.81 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  28.77 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  27.78 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  33.11 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  30.61 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  28.39 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  28.19 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  27.97 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  28.39 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  27.89 
 
 		 287 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  29.03 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  28.86 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  28.4 
 
 		 301 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  29.29 
 
 		 143 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.66 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 142 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  29.45 
 
 		 156 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  26.9 
 
 		 152 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  29.8 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  25.52 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  28.08 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  27.4 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  28.67 
 
 		 415 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  27.39 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  26 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  29.22 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  24.09 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  24.26 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  26.14 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  25.34 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.82 
 
 		 143 aa  40.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.25 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  25.17 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  26.14 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  30.61 
 
 		 301 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3813  UspA domain-containing protein  29.8 
 
 		 156 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.175974  normal  0.56362 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>