105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3554 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 319 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.14 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.48 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  26.58 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.87 
 
 		 314 aa  80.1  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.49 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  30.65 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  28.16 
 
 		 321 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.45 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.17 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.03 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.83 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.62 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.48 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.69 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.21 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.68 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.36 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.36 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.71 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  25.76 
 
 		 334 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0347  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.7 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.63 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  24.04 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.32 
 
 		 354 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0327  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.23 
 
 		 343 aa  53.9  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.49 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.04 
 
 		 327 aa  53.9  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 		 231 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 358 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  26.55 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07085  hypothetical protein  23.51 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  31.21 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2626  hypothetical protein  25.52 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.22 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.01 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.88 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  26.1 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  29.02 
 
 		 263 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25 
 
 		 339 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  27.84 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  30.97 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1212  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.44 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  24.22 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  30.32 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  26.9 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  30.17 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  28.39 
 
 		 261 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.51 
 
 		 576 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  24.37 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  23.71 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.98 
 
 		 354 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.89 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  26.83 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.34 
 
 		 323 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  25.93 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  33.02 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0442  exodeoxyribonuclease III  25.41 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3233  exodeoxyribonuclease III Xth  25.99 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3054  exodeoxyribonuclease III  28.4 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.589919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  30.49 
 
 		 267 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1863  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.79 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.66 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.15 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  25.4 
 
 		 359 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.32 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0660  exodeoxyribonuclease III  29.22 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969043  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0692  exodeoxyribonuclease III  29.22 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000190547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  28.03 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0194  exodeoxyribonuclease III Xth  36.08 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.074274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.22 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.17 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1294  exodeoxyribonuclease III Xth  25.77 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.956147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.5 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.44 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  27.81 
 
 		 673 aa  43.5  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  25.26 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.02 
 
 		 266 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.8 
 
 		 359 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  26.83 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  28.5 
 
 		 264 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2045  sphingomyelin phosphodiesterase  27.81 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.664493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.7 
 
 		 242 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0045  exodeoxyribonuclease III Xth  26.86 
 
 		 270 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.278915  normal  0.0499995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.62 
 
 		 282 aa  43.5  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2004  exodeoxyribonuclease III  27.67 
 
 		 268 aa  43.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.35 
 
 		 355 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 		 264 aa  43.1  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1927  exodeoxyribonuclease III  27.67 
 
 		 289 aa  43.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>