48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3419 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  100 
 
 		 339 aa  699    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.71 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.26 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1212  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.94 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.79 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07085  hypothetical protein  31.86 
 
 		 340 aa  156  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0859  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.86 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  26.81 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  23.42 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.57 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.4 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.05 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.02 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.02 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.14 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.3 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.35 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.43 
 
 		 242 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.35 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.8 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.13 
 
 		 319 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.75 
 
 		 249 aa  50.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.89 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0347  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.56 
 
 		 235 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.82 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.21 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.39 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4996  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.36 
 
 		 334 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13807  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.93 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219654  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.64 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.85 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.03 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0327  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.44 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  23.27 
 
 		 321 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.97 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.97 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.89 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  20.4 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32760  metal-dependent hydrolase  28.57 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244056  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.36 
 
 		 236 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  21.66 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.04 
 
 		 808 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1812  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.53 
 
 		 328 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.53 
 
 		 328 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.25 
 
 		 266 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>