130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0980 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
249 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.3 
 
 
235 aa  189  4e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.61 
 
 
236 aa  158  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2702  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.02 
 
 
232 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  42.79 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1309  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.58 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226265  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3505  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.35 
 
 
236 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443664 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.85 
 
 
232 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3237  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.24 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32760  metal-dependent hydrolase  39.75 
 
 
251 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244056  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.68 
 
 
260 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2205  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.68 
 
 
260 aa  85.1  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.586211  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.37 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11820  metal-dependent hydrolase  35.83 
 
 
244 aa  79  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 
328 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.6 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
242 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.48 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.03 
 
 
837 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.87 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.88 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.32 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.32 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.95 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.43 
 
 
808 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.02 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.51 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.85 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  26.29 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.57 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.81 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.53 
 
 
282 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1916  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.44 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  31.87 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.51 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.03 
 
 
305 aa  59.3  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.33 
 
 
240 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.09 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
271 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.87 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.87 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.6 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.43 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.58 
 
 
252 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  36.09 
 
 
286 aa  55.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 
263 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 
263 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.71 
 
 
287 aa  55.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.29 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.13 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.76 
 
 
370 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  25.6 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  28.69 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.22 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.38 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.89 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.85 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.97 
 
 
271 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.06 
 
 
299 aa  52.4  0.000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  30.52 
 
 
338 aa  52  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1779  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.27 
 
 
261 aa  52.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  24.4 
 
 
372 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.6 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.16 
 
 
257 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.73 
 
 
373 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.59 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.59 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.1 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.75 
 
 
339 aa  50.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.91 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.85 
 
 
338 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4762  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 
299 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.99 
 
 
232 aa  49.7  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.82 
 
 
236 aa  49.7  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.12 
 
 
371 aa  49.3  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.09 
 
 
278 aa  48.9  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
243 aa  48.9  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.06 
 
 
282 aa  48.9  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 
265 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 
255 aa  48.9  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.23 
 
 
266 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.03 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.32 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  33.33 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  28.14 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.61 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.18 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.51 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.27 
 
 
285 aa  47  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.43 
 
 
261 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>