29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1212 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1212  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 372 aa  759    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.11 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.14 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.19 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.96 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0859  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.8 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07085  hypothetical protein  23.16 
 
 		 340 aa  98.6  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  30.51 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.23 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.04 
 
 		 332 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.424253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0347  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.14 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.44 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0327  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.03 
 
 		 343 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 304 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  29.17 
 
 		 372 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 		 249 aa  46.6  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0478352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 		 373 aa  46.2  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.01 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.69 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.48 
 
 		 244 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.06 
 
 		 356 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  29.9 
 
 		 359 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.13 
 
 		 236 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 		 359 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.29 
 
 		 365 aa  43.1  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.29 
 
 		 365 aa  43.1  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>