46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2987 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 359 aa  733    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.05 
 
 		 359 aa  355  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  47.25 
 
 		 372 aa  322  7e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.09 
 
 		 373 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.19 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.68 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.29 
 
 		 365 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.29 
 
 		 365 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.94 
 
 		 355 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  50.67 
 
 		 325 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  43.67 
 
 		 367 aa  289  4e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.61 
 
 		 358 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.09 
 
 		 354 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.61 
 
 		 353 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.06 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.07 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.12 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.95 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  24.43 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  24.43 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.21 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.16 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.91 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.68 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  24.3 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.16 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  26.23 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.89 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.12 
 
 		 305 aa  52.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.11 
 
 		 340 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.29 
 
 		 299 aa  51.2  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.07 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.32 
 
 		 335 aa  49.7  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.08 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.58 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.99 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  25.21 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.78 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.46 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.66 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.69 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.27 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.27 
 
 		 326 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1212  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.9 
 
 		 372 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2779  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.27 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>