58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4164 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 335 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.56 
 
 		 325 aa  99.4  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 		 340 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.9 
 
 		 340 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  25.36 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  28.95 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.91 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.55 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.18 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.78 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.78 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.43 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.82 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.74 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  26.95 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.77 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.31 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.19 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.61 
 
 		 356 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.73 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  26.35 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  28.19 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.57 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  27.55 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  25.6 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  30.67 
 
 		 334 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.39 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.37 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.03 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.84 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.5 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.74 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.29 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 		 246 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  28.24 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.86 
 
 		 246 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.83 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  25.98 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  27.66 
 
 		 334 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 330 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 330 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.11 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.13 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  25.21 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.05 
 
 		 370 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  24.84 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  29.37 
 
 		 369 aa  43.1  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.66 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.47 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  32.37 
 
 		 321 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>