53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2674 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
344 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.67 
 
 
318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.16 
 
 
312 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.63 
 
 
318 aa  152  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.99 
 
 
314 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.34 
 
 
327 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.74 
 
 
305 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.85 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  34.14 
 
 
334 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.48 
 
 
312 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 
330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 
330 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.88 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  35 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 
341 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  34.33 
 
 
313 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.87 
 
 
328 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.12 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.92 
 
 
323 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.59 
 
 
328 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.58 
 
 
357 aa  106  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.05 
 
 
314 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.22 
 
 
356 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.22 
 
 
351 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  30.54 
 
 
320 aa  92  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.82 
 
 
331 aa  89  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 
351 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  27.69 
 
 
369 aa  73.2  0.000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  29.79 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.73 
 
 
348 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.57 
 
 
319 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.61 
 
 
335 aa  54.7  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.15 
 
 
326 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 
365 aa  49.7  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 
365 aa  49.7  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  26.59 
 
 
321 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  26.34 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.61 
 
 
325 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1863  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.74 
 
 
392 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97552  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  26.04 
 
 
367 aa  46.6  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.9 
 
 
354 aa  46.2  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  26.99 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 
359 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  33.88 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.82 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.83 
 
 
365 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.21 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.22 
 
 
373 aa  43.9  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0346  putative nuclease  23.38 
 
 
319 aa  43.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0268024  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.73 
 
 
353 aa  43.1  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.73 
 
 
353 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>