67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2500 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  52.85 
 
 		 313 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.1 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  43.69 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.21 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.3 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.1 
 
 		 323 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.61 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.03 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.66 
 
 		 351 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.14 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.23 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.41 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.83 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.14 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.34 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.25 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.63 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.86 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.91 
 
 		 312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.89 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.78 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.17 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  31.47 
 
 		 320 aa  99.4  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.67 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.64 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.38 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  35.84 
 
 		 200 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  28.7 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.76 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.74 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.67 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  43.2 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  25.84 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  25.84 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.59 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.68 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.17 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  24.31 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.04 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  24.21 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 		 358 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.24 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  27.82 
 
 		 299 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.12 
 
 		 335 aa  52.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.33 
 
 		 340 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.63 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.17 
 
 		 373 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  24.79 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  25.1 
 
 		 673 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.09 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.82 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.48 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.85 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.38 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  26.38 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.66 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0452  hypothetical protein  20.07 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.23 
 
 		 353 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.02 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.77 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4996  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.1 
 
 		 334 aa  43.9  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13807  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.45 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>