35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2399 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
341 aa  662    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.62 
 
 
351 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  35.6 
 
 
334 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.61 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.75 
 
 
351 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.99 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.52 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  34.65 
 
 
313 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.05 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.7 
 
 
357 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.49 
 
 
314 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  33.63 
 
 
334 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.45 
 
 
312 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.4 
 
 
323 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  32.68 
 
 
369 aa  104  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.34 
 
 
331 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.48 
 
 
312 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  33.92 
 
 
320 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.6 
 
 
323 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
344 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.19 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.89 
 
 
323 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.59 
 
 
356 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.92 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.61 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.47 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.1 
 
 
391 aa  72.8  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.18 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.18 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  33.7 
 
 
200 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  33.33 
 
 
365 aa  57  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  36.27 
 
 
352 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0783  hypothetical protein  33.88 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.16 
 
 
328 aa  43.5  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>