78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3087 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 318 aa  629  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  58.1 
 
 		 314 aa  341  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.86 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.93 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.57 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.9 
 
 		 323 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.29 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.75 
 
 		 327 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.69 
 
 		 318 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.49 
 
 		 312 aa  129  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.03 
 
 		 328 aa  122  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  34.23 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.97 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  34.62 
 
 		 313 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.55 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.55 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.32 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  33.48 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.27 
 
 		 328 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  30.28 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.29 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.19 
 
 		 341 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.88 
 
 		 356 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.55 
 
 		 331 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.24 
 
 		 357 aa  89.7  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.03 
 
 		 351 aa  86.3  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.28 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.69 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  26.37 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  29.31 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  36.46 
 
 		 200 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  36.4 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.04 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.45 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  24.57 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.4 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0346  putative nuclease  22.92 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0268024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  26.91 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.87 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  26.28 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.37 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  30.38 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  30.38 
 
 		 357 aa  55.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.4 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  26.81 
 
 		 673 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.54 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.42 
 
 		 371 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.5 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  26.62 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  27.62 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1391  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.47 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  25.17 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.79 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.32 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  27.45 
 
 		 657 aa  46.6  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  27.8 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  26.29 
 
 		 302 aa  45.8  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1001  exodeoxyribonuclease III  27.78 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0471864  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.44 
 
 		 591 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1863  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.18 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0783  hypothetical protein  30.89 
 
 		 177 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  23.46 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  34.41 
 
 		 617 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2319  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.159993  hitchhiker  0.001053 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.77 
 
 		 257 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 		 326 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.33 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.39 
 
 		 250 aa  43.5  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.98478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.18 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.13 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.27 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.27 
 
 		 255 aa  42.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>