90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6275 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  100 
 
 		 617 aa  1182    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.98 
 
 		 634 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  35.37 
 
 		 673 aa  270  5e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.14 
 
 		 639 aa  140  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.55 
 
 		 591 aa  139  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  27.09 
 
 		 639 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.84 
 
 		 644 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  30.91 
 
 		 657 aa  92  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.7 
 
 		 837 aa  89.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.62 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.84 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 		 244 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.12 
 
 		 266 aa  73.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.27 
 
 		 808 aa  72  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.14 
 
 		 236 aa  69.7  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.51 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  30.65 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.94 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.66 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 		 278 aa  66.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.48 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 		 242 aa  62  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 		 257 aa  60.1  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.7 
 
 		 260 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.42 
 
 		 242 aa  59.7  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.17 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  33.13 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.31 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.39 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  28.88 
 
 		 286 aa  56.6  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.65 
 
 		 228 aa  56.2  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.2 
 
 		 269 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05400  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  28.9 
 
 		 920 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.84 
 
 		 271 aa  55.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.5 
 
 		 278 aa  55.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.14 
 
 		 255 aa  54.7  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05011  integral plasma membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09740)  26.29 
 
 		 949 aa  53.9  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0782168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.59 
 
 		 269 aa  53.9  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4122  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.49 
 
 		 287 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 		 328 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 		 255 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.59 
 
 		 269 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2093  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.86 
 
 		 284 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 		 255 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  29.32 
 
 		 316 aa  52  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 		 328 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 		 226 aa  52.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 		 255 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.82 
 
 		 242 aa  51.6  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.63 
 
 		 282 aa  51.2  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.16 
 
 		 283 aa  51.2  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 		 260 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.78 
 
 		 248 aa  50.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1349  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 		 287 aa  50.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.442404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.52 
 
 		 276 aa  48.9  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.34 
 
 		 294 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4197  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.61 
 
 		 288 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.03 
 
 		 354 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.78 
 
 		 245 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.7 
 
 		 250 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.94 
 
 		 314 aa  47.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.7 
 
 		 258 aa  47.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0330  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.97 
 
 		 262 aa  47.4  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0263555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32760  metal-dependent hydrolase  38.83 
 
 		 251 aa  46.6  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.244056  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.16 
 
 		 278 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0964  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.32 
 
 		 287 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 		 258 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 		 265 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.67 
 
 		 258 aa  46.2  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3505  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.33 
 
 		 236 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.28 
 
 		 268 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.89 
 
 		 371 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  31.49 
 
 		 277 aa  45.4  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.26 
 
 		 257 aa  45.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 		 289 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2555  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.87 
 
 		 257 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.337597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.41 
 
 		 318 aa  45.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.26 
 
 		 288 aa  44.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2113  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.62 
 
 		 284 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0578211  normal  0.225636 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.38 
 
 		 263 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 		 233 aa  44.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.05 
 
 		 243 aa  44.3  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.38 
 
 		 263 aa  44.3  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.16 
 
 		 314 aa  44.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.05 
 
 		 252 aa  44.3  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0143  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.73 
 
 		 284 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3567  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 		 286 aa  43.9  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.202667  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.02 
 
 		 387 aa  43.9  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>