22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1863 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1863  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
392 aa  769    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97552  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.31 
 
 
304 aa  150  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  33.43 
 
 
299 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  33.22 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  34.52 
 
 
321 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.05 
 
 
293 aa  123  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2626  hypothetical protein  32.59 
 
 
347 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.89 
 
 
314 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.09 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0347  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.18 
 
 
343 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 
356 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.16 
 
 
314 aa  50.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.55 
 
 
304 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
319 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.65 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.09 
 
 
344 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.02 
 
 
252 aa  44.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0327  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.31 
 
 
343 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 
371 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
245 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>