36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4758 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  712    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.59 
 
 		 304 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2626  hypothetical protein  50.78 
 
 		 347 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  37.94 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.14 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1863  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.12 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.74 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.74 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.42 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.92 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.1 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.89 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.75 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  25.82 
 
 		 334 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.2 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07085  hypothetical protein  23.19 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.62 
 
 		 318 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.37 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.7 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.53 
 
 		 319 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.59 
 
 		 318 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  24.4 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.51 
 
 		 370 aa  46.2  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  31.94 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  23.97 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  25.64 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  23.68 
 
 		 308 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.07 
 
 		 370 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.02 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.29 
 
 		 328 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.08 
 
 		 371 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.73 
 
 		 246 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>