78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1156 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 370 aa  721    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.91 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.74 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.78 
 
 		 354 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219654  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.59 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.2 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.78 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.58 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.58 
 
 		 242 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.45 
 
 		 246 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3092  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.75 
 
 		 387 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.45 
 
 		 246 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.27 
 
 		 808 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 		 236 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  41.46 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.41 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.76 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 249 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.53 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0859  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.12 
 
 		 367 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.54 
 
 		 232 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.96 
 
 		 242 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.17 
 
 		 257 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.29 
 
 		 266 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.78 
 
 		 278 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  33.98 
 
 		 232 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.24 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.11 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.295355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  34.86 
 
 		 286 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.68 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.45 
 
 		 283 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3237  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.5 
 
 		 251 aa  47  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.207462  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.55 
 
 		 330 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.55 
 
 		 330 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.54 
 
 		 235 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.73 
 
 		 236 aa  46.6  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.29 
 
 		 265 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.63 
 
 		 837 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.15 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  27.51 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  32.67 
 
 		 321 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.35 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4337  putative metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2626  hypothetical protein  37.5 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.04 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.18 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33 
 
 		 250 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.94 
 
 		 260 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.63 
 
 		 271 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.85 
 
 		 362 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.04 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3096  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.64 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.64 
 
 		 271 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.92 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.92 
 
 		 252 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3052  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.51 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2438  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.51 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3071  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.51 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51453 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.05 
 
 		 335 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.77 
 
 		 328 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.51 
 
 		 271 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.65 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.14 
 
 		 247 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.43 
 
 		 236 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.28 
 
 		 269 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0102  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 265 aa  43.1  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2960  hypothetical protein  33.64 
 
 		 270 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2128  hypothetical protein  33.64 
 
 		 270 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0235  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.64 
 
 		 270 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.102348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0247  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.64 
 
 		 270 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3386  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.64 
 
 		 270 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0429  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.64 
 
 		 270 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0125577  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3294  hypothetical protein  33.64 
 
 		 230 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1212  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.08 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>