64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1262 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
305 aa  585  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  50.49 
 
 
334 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.35 
 
 
328 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.47 
 
 
328 aa  225  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.13 
 
 
331 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  45.21 
 
 
334 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  42.53 
 
 
313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.45 
 
 
327 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.92 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.31 
 
 
351 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.36 
 
 
314 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.56 
 
 
312 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.93 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.3 
 
 
312 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.58 
 
 
351 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.3 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.3 
 
 
330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.99 
 
 
341 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.26 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.33 
 
 
323 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  35.45 
 
 
320 aa  123  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.26 
 
 
323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.81 
 
 
318 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.51 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.21 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.64 
 
 
344 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
314 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  28.69 
 
 
369 aa  89.7  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.07 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.75 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  34.89 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  29.97 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  46.23 
 
 
200 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.36 
 
 
358 aa  64.7  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.2 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.98 
 
 
340 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.48 
 
 
319 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.75 
 
 
328 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0452  hypothetical protein  31.09 
 
 
338 aa  59.3  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.57 
 
 
371 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 
335 aa  56.6  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  27.68 
 
 
322 aa  56.2  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  27.21 
 
 
357 aa  56.2  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.97 
 
 
340 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.58 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.58 
 
 
340 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  24.12 
 
 
359 aa  52.8  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.01 
 
 
353 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.62 
 
 
358 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.73 
 
 
353 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 
354 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  28.88 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  25.55 
 
 
367 aa  50.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.38 
 
 
365 aa  49.7  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  24.19 
 
 
308 aa  49.3  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  25.11 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.83 
 
 
355 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  25.98 
 
 
304 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.68 
 
 
370 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  29.12 
 
 
299 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  35 
 
 
365 aa  45.4  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.99 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.33 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  27.24 
 
 
286 aa  42.7  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>