46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1678 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
331 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.29 
 
 
330 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.29 
 
 
330 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.23 
 
 
323 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.08 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.39 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.8 
 
 
312 aa  139  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.26 
 
 
305 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  33.56 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.76 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.97 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.99 
 
 
318 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.86 
 
 
312 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.85 
 
 
323 aa  109  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  34.89 
 
 
334 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  32.61 
 
 
320 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.12 
 
 
344 aa  106  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  31.03 
 
 
313 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.9 
 
 
357 aa  105  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.86 
 
 
331 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.89 
 
 
328 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  31.44 
 
 
369 aa  93.6  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.61 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.93 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.07 
 
 
351 aa  89.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.01 
 
 
356 aa  89  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.22 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.04 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.73 
 
 
391 aa  79.3  0.00000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.86 
 
 
348 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.84 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.03 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.59 
 
 
335 aa  60.1  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.71 
 
 
304 aa  56.2  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  25.24 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.18 
 
 
371 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  37.69 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  27.73 
 
 
299 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2626  hypothetical protein  29.74 
 
 
347 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
340 aa  47  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 
293 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  33.07 
 
 
365 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  37.21 
 
 
200 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  27.91 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.17 
 
 
337 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  26.63 
 
 
321 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>