45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1883 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
357 aa  729    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  36.49 
 
 
320 aa  177  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  35.06 
 
 
369 aa  142  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.27 
 
 
351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  30.06 
 
 
334 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.7 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.09 
 
 
312 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.51 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.24 
 
 
391 aa  109  6e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.63 
 
 
351 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.88 
 
 
312 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.17 
 
 
323 aa  99.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  29.25 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.45 
 
 
323 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.45 
 
 
331 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.24 
 
 
318 aa  89.7  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.3 
 
 
344 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.61 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 
328 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.38 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.03 
 
 
331 aa  84  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  27.67 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.43 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.6 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.23 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.38 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  30.08 
 
 
200 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.26 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.71 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  25.22 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  31.97 
 
 
352 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  27.39 
 
 
299 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.82 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  25.31 
 
 
308 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0346  putative nuclease  24.14 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0268024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.87 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.43 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.69 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  22.66 
 
 
359 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.58 
 
 
340 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  24.92 
 
 
321 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>