61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2919 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
312 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.57 
 
 
323 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.91 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.09 
 
 
323 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.61 
 
 
312 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.17 
 
 
318 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  36.64 
 
 
320 aa  132  6e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.99 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.96 
 
 
327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.16 
 
 
318 aa  126  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  36.11 
 
 
313 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  36.68 
 
 
334 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.47 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.47 
 
 
330 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32 
 
 
357 aa  119  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.58 
 
 
351 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.91 
 
 
328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.47 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.27 
 
 
331 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.78 
 
 
314 aa  114  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  31.8 
 
 
334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.92 
 
 
344 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.55 
 
 
341 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.87 
 
 
331 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
351 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  30.21 
 
 
369 aa  99  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.32 
 
 
356 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.28 
 
 
314 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.89 
 
 
391 aa  82.4  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.47 
 
 
348 aa  75.9  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  41.6 
 
 
200 aa  72  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.62 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  44.76 
 
 
352 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30 
 
 
250 aa  62.4  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
258 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  28.02 
 
 
639 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  29.41 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.37 
 
 
304 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.61 
 
 
591 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.04 
 
 
639 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0783  hypothetical protein  35.29 
 
 
177 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  28.52 
 
 
321 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.81 
 
 
371 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.42 
 
 
304 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  25.52 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.35 
 
 
340 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.22 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  27.44 
 
 
673 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
340 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.13 
 
 
319 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.01 
 
 
335 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.6 
 
 
324 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.84 
 
 
293 aa  46.2  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  32.81 
 
 
617 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.23 
 
 
634 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.7 
 
 
335 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  25.74 
 
 
358 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.17 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.03 
 
 
236 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>