54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3933 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 318 aa  614  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.33 
 
 		 344 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.1 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.75 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.68 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.69 
 
 		 327 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.06 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.76 
 
 		 305 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  31.61 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 		 330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  32.17 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.68 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.11 
 
 		 331 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.28 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  29.29 
 
 		 320 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.09 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.45 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.61 
 
 		 356 aa  102  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.96 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  30.82 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.4 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.12 
 
 		 351 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.28 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 		 341 aa  85.9  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.56 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.45 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  28.45 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.85 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  30.17 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  27.24 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  23.87 
 
 		 372 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.86 
 
 		 340 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  30.99 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  28.16 
 
 		 338 aa  52.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24 
 
 		 373 aa  52.8  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0783  hypothetical protein  30.57 
 
 		 177 aa  50.8  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 304 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.7 
 
 		 359 aa  49.3  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.2 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  26.18 
 
 		 359 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  26.94 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.83 
 
 		 328 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 		 365 aa  46.2  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.17 
 
 		 365 aa  46.2  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  24.28 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.09 
 
 		 324 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.81 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.74 
 
 		 371 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.28 
 
 		 340 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24 
 
 		 325 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.28 
 
 		 340 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>