55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4122 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
326 aa  651    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.79 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  30.9 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  30.17 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.19 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.16 
 
 
358 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.68 
 
 
356 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  24.9 
 
 
325 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.45 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.18 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  28.45 
 
 
313 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0346  putative nuclease  24.29 
 
 
319 aa  59.7  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0268024  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.83 
 
 
354 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.58 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.28 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.07 
 
 
340 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.57 
 
 
365 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.88 
 
 
355 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.37 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.65 
 
 
312 aa  52  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.59 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.59 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.81 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.79 
 
 
335 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  24.23 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.7 
 
 
312 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  25.19 
 
 
334 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.39 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 
344 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.26 
 
 
314 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 
335 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 
318 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  24.53 
 
 
357 aa  46.6  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.31 
 
 
299 aa  46.2  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
351 aa  46.2  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.52 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.52 
 
 
365 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.83 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  24.79 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.21 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.25 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.25 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  24.53 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.77 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.39 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  25.84 
 
 
358 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  22.27 
 
 
359 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  23.48 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  20.51 
 
 
372 aa  42.7  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  29.77 
 
 
369 aa  42.4  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.72 
 
 
358 aa  42.7  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>