45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0258 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  99.41 
 
 
340 aa  693    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
340 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.9 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.33 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.96 
 
 
335 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.82 
 
 
314 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.83 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.74 
 
 
327 aa  60.8  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  24.84 
 
 
313 aa  59.7  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.38 
 
 
348 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.58 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  23.21 
 
 
372 aa  55.8  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  24.23 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.94 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.49 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.01 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.82 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  25.08 
 
 
308 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.58 
 
 
305 aa  53.1  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.4 
 
 
365 aa  52.8  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.14 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  24.36 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  23.33 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.81 
 
 
326 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  22.74 
 
 
325 aa  50.4  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  24.1 
 
 
320 aa  49.7  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  22.08 
 
 
359 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.22 
 
 
387 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.17 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.54 
 
 
331 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.18 
 
 
312 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.82 
 
 
326 aa  46.6  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.93 
 
 
328 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3043  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.4 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.524343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2779  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.09 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.17 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.63 
 
 
359 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  23.18 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.58 
 
 
353 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.18 
 
 
353 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.71 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.71 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.51 
 
 
328 aa  43.5  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  23.04 
 
 
244 aa  43.1  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000326697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  25.15 
 
 
262 aa  42.7  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>