40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4138 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  668    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  49.69 
 
 		 359 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.5 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.68 
 
 		 359 aa  291  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.74 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.81 
 
 		 355 aa  258  7e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.67 
 
 		 373 aa  256  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  42.19 
 
 		 372 aa  252  6e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.99 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.99 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.68 
 
 		 365 aa  238  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.68 
 
 		 365 aa  238  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  41.45 
 
 		 367 aa  231  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.58 
 
 		 353 aa  228  9e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.26 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.65 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.56 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.94 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.52 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  24.89 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  25.11 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.24 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.11 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.4 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.08 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.37 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.1 
 
 		 340 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.74 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.52 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  23.25 
 
 		 673 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  31.07 
 
 		 313 aa  45.8  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.29 
 
 		 248 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.67 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.2 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.81 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.22 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1572  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.816455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.75 
 
 		 335 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1212  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 		 372 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>