48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2107 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  741    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  43.48 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.07 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.88 
 
 		 359 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.62 
 
 		 373 aa  294  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.18 
 
 		 358 aa  293  5e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  42.62 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.89 
 
 		 355 aa  279  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.85 
 
 		 365 aa  272  7e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.85 
 
 		 365 aa  272  7e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.27 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.5 
 
 		 354 aa  259  7e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.36 
 
 		 365 aa  258  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.48 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  41.75 
 
 		 325 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.12 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.34 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  26.86 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  28.1 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.19 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.26 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.42 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.48 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.96 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.17 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  26.47 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.55 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 		 242 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.26 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.56 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.79 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.88 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.08 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.61 
 
 		 340 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.61 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.74 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.67 
 
 		 287 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.05 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.77 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  26.92 
 
 		 334 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  26.61 
 
 		 321 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.29 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.18 
 
 		 335 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>