74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8349 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.13 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.49 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.73 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.07 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  45.19 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  43.85 
 
 		 334 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.92 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.33 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.04 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.47 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  36.87 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.9 
 
 		 357 aa  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.14 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.53 
 
 		 351 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.71 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.47 
 
 		 331 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.62 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.62 
 
 		 330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.12 
 
 		 318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.63 
 
 		 318 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 		 314 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.9 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.99 
 
 		 348 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.22 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  29 
 
 		 369 aa  86.3  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.21 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.02 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  27.11 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  27.11 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0233  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.04 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.82 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  38.84 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0783  hypothetical protein  38.14 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 		 246 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.73 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26820  hypothetical protein  46.25 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.873758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.67 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.37 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.46 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.6 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.46 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  24.06 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.21 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.46 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0452  hypothetical protein  27.12 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  32.26 
 
 		 365 aa  48.5  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.49 
 
 		 324 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.25 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.25 
 
 		 353 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 359 aa  47  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.91 
 
 		 326 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  25.32 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.61 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  24.44 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0347  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.46 
 
 		 343 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.68 
 
 		 304 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0286  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.94 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.73 
 
 		 359 aa  43.5  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.21 
 
 		 299 aa  43.5  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.55 
 
 		 283 aa  42.7  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.71 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.71 
 
 		 365 aa  42.7  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0327  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.62 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  27.4 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  26.92 
 
 		 367 aa  42.4  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>