49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1051 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  100 
 
 
369 aa  754    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0327  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.57 
 
 
391 aa  192  9e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.552069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.06 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2153  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
351 aa  106  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000796237 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  31.9 
 
 
320 aa  105  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.68 
 
 
341 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.28 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.78 
 
 
312 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.44 
 
 
331 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.17 
 
 
312 aa  93.6  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.74 
 
 
330 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.74 
 
 
330 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 
305 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  29.44 
 
 
334 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.24 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.87 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.15 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
328 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  28.7 
 
 
334 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.87 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  27.91 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.31 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 
344 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.62 
 
 
318 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.9 
 
 
356 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.63 
 
 
348 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3447  integral membrane protein  31.63 
 
 
200 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.05 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.55 
 
 
288 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.79 
 
 
323 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  32.99 
 
 
365 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  26.47 
 
 
367 aa  50.8  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.65 
 
 
250 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.65 
 
 
258 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.61 
 
 
290 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.742577  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.79 
 
 
340 aa  49.3  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.06 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.71 
 
 
319 aa  46.6  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0093  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.43 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.35 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.7 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2601  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.53 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.792599  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2832  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 
260 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313269  decreased coverage  0.00271528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.88 
 
 
371 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.37 
 
 
335 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  33.33 
 
 
617 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.4 
 
 
325 aa  42.7  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>