172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0656 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 348 aa  699    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.18 
 
 		 319 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.46 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.53 
 
 		 304 aa  96.3  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8349  hypothetical protein  30.99 
 
 		 334 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.96 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  28.15 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.69 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.8 
 
 		 371 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  25.38 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.86 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1499  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.581311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1262  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.75 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.338722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.88 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7816  Metal-dependent hydrolase-like protein  26.73 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  29.87 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.92 
 
 		 312 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  27.38 
 
 		 334 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.51 
 
 		 327 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.01 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.57 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0337  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.72 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  28 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0327  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.84 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.62 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  29.04 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.67 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0347  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.2 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.03 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.78 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.14 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.87 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0219654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2657  exodeoxyribonuclease III  34.38 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.107023  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1315  exodeoxyribonuclease III  34.38 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1195  exodeoxyribonuclease III Xth  31.25 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.206462  normal  0.651553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  19.93 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1244  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.2 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.27 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.08 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0035  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.01 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.163228  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1134  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.62 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2815  exodeoxyribonuclease III  32.1 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0879261  normal  0.730816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1212  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 		 372 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 		 266 aa  57  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0897  exodeoxyribonuclease III  30.11 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1051  metal-dependent hydrolase  27.63 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4996  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.91 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13807  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.82 
 
 		 249 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2747  exodeoxyribonuclease III  27.22 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614534  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0667  hypothetical protein  24.77 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.906928  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.31 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  24.37 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.51 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  24.92 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.29 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 		 246 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.44 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.87 
 
 		 267 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29 
 
 		 323 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  24.71 
 
 		 262 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  27.04 
 
 		 261 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.515839  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 		 242 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  25.23 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.82 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.51 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.34 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.66 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2898  exodeoxyribonuclease III  31.74 
 
 		 284 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1156  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.53 
 
 		 370 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.876276  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0929  exodeoxyribonuclease III Xth  26.54 
 
 		 261 aa  50.8  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0877  exodeoxyribonuclease III Xth  29.09 
 
 		 264 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  25.18 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  31.21 
 
 		 264 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2890  exonuclease III  27.67 
 
 		 270 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00987023  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2476  exonuclease III  25.32 
 
 		 270 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1362  normal  0.165238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  22.09 
 
 		 263 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  24.15 
 
 		 372 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  22.78 
 
 		 267 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5653  exodeoxyribonuclease III Xth  27.76 
 
 		 260 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.248061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1637  exonuclease III  26.54 
 
 		 270 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00257363  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 		 277 aa  49.7  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.241981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2399  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.81 
 
 		 341 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02430  exodeoxyribonuclease III  27.54 
 
 		 269 aa  49.3  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.977241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1964  exodeoxyribonuclease III  26.42 
 
 		 268 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3190  exodeoxyribonuclease III  25.88 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1207  exodeoxyribonuclease III (xth)  30.57 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.87 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  25.95 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1956  exodeoxyribonuclease III Xth  24.59 
 
 		 264 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0751549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2232  exodeoxyribonuclease III Xth  24.59 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.410107 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4232  exodeoxyribonuclease III  29.61 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00320873  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  24.79 
 
 		 270 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.6811 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>