61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2189 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 324 aa  648    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.65 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.69 
 
 		 337 aa  93.2  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.46 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.08 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  32.47 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1523  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  32.47 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.6 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1522  hypothetical protein  22.66 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.894535  normal  0.0489595 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01235  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.53 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.201786  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  27.66 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3875  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.17 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3585  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.17 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.13 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.83 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1700  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.31 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.119105  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4164  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.43 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427821  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1790  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.19 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3057  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.18 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  22.91 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2779  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.85 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0885  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.56 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0197424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1029  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.56 
 
 		 365 aa  59.3  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0708398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2107  hypothetical protein  28.26 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  23.4 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.06 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.1 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  27.74 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3661  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.1 
 
 		 356 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.680606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.35 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.4 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2213  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.23 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3043  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.9 
 
 		 310 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.524343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06361  hypothetical protein  26.27 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 		 327 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2626  hypothetical protein  27.78 
 
 		 347 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.68 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.1 
 
 		 371 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2958  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.19 
 
 		 331 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0313395  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.58 
 
 		 253 aa  46.2  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.17 
 
 		 340 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.57 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  23.86 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.6 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6062  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.42 
 
 		 236 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.640142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.44 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.61 
 
 		 314 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3537  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.37 
 
 		 351 aa  43.5  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.737818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.63 
 
 		 236 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.6 
 
 		 348 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.92 
 
 		 242 aa  42.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>