17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2779 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2779  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
310 aa  630  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3043  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  90 
 
 
310 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.524343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.02 
 
 
318 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.07 
 
 
318 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  39.94 
 
 
313 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.04 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.43 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  23.34 
 
 
357 aa  65.1  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  23.34 
 
 
322 aa  63.2  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.85 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.29 
 
 
312 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.37 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0260  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.09 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.76 
 
 
340 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1106  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.86 
 
 
358 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.86 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2987  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 
359 aa  43.5  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>