23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2996 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
318 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  88.05 
 
 
318 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3043  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  53.72 
 
 
310 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.524343 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2779  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.02 
 
 
310 aa  346  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3207  hypothetical protein  40.38 
 
 
313 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.204724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0914  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.66 
 
 
335 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2657  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.18 
 
 
337 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0621  AP endonuclease domain-containing protein  25.09 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0622  AP endonuclease domain-containing protein  25.09 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2189  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.44 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4122  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.3 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1015  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.39 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.382783  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.79 
 
 
344 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1778  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
299 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0099655  normal  0.734329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  23.5 
 
 
334 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.6 
 
 
1007 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.39 
 
 
314 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4138  hypothetical protein  29.2 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3087  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.26 
 
 
318 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0757532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3798  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.24 
 
 
263 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00159012  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0649  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.33 
 
 
250 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.441021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0800  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.33 
 
 
258 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.179814  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0416  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.17 
 
 
340 aa  42.7  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0988611  normal  0.136356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>