22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7068 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
1007 aa  1955    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3033  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.47 
 
 
895 aa  452  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.214137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2526  hypothetical protein  35.64 
 
 
191 aa  89  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00348782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.02 
 
 
249 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401875  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 
297 aa  58.9  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.21 
 
 
291 aa  53.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6162  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.31 
 
 
252 aa  53.5  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0634319  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1111  hypothetical protein  28.23 
 
 
351 aa  51.6  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  29 
 
 
286 aa  50.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0879  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 
173 aa  49.7  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.447955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3678  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.18 
 
 
437 aa  49.3  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.322426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.85 
 
 
235 aa  48.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50571  predicted protein  29.63 
 
 
346 aa  48.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2753  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.57 
 
 
296 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.6 
 
 
318 aa  46.2  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46676  predicted protein  30.59 
 
 
1423 aa  45.8  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
245 aa  45.1  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.325788  normal  0.617389 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85400  Poly(A) polymerase PAPalpha (Polynucleotide adenylyltransferase alpha)  24.12 
 
 
556 aa  45.4  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05330  polynucleotide adenylyltransferase, putative  22.86 
 
 
642 aa  45.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0522  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 
305 aa  45.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003888  putative phospholipase C  25.41 
 
 
442 aa  45.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47057  predicted protein  29.55 
 
 
1458 aa  45.1  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>