26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3033 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3033  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 895 aa  1697    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.214137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.64 
 
 		 1007 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.27 
 
 		 249 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401875  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2526  hypothetical protein  34.81 
 
 		 191 aa  68.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00348782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2679  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.76 
 
 		 297 aa  60.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00635777  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.38 
 
 		 236 aa  52.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16020  predicted protein  27.89 
 
 		 325 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.378797  normal  0.0106651 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G13650)  25.41 
 
 		 340 aa  49.3  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.529831 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0817  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 		 265 aa  48.9  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.49 
 
 		 340 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0181271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.14 
 
 		 250 aa  47.8  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.19 
 
 		 314 aa  47.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 		 249 aa  47.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47826  predicted protein  40 
 
 		 777 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  31.25 
 
 		 188 aa  47.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.76 
 
 		 252 aa  46.6  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1665  hypothetical protein  26.98 
 
 		 173 aa  46.2  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.9 
 
 		 265 aa  45.8  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  22.73 
 
 		 310 aa  46.2  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50571  predicted protein  27.94 
 
 		 346 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3245  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.12 
 
 		 318 aa  45.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.73 
 
 		 278 aa  45.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.57 
 
 		 365 aa  45.4  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 		 291 aa  45.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2996  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.44 
 
 		 318 aa  45.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05330  polynucleotide adenylyltransferase, putative  21.94 
 
 		 642 aa  45.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>