14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1111 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1111  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  691    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1804  endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.74 
 
 		 363 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4865  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.9 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3662  hypothetical protein  45.28 
 
 		 351 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2341  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.44 
 
 		 475 aa  65.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  27.59 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.85 
 
 		 1007 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2087  sphingomyelin phosphodiesterase  29.25 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213788  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04769  hypothetical protein  27.62 
 
 		 451 aa  52.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  26.79 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.48 
 
 		 375 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01777  hypothetical protein  22.79 
 
 		 446 aa  46.2  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003888  putative phospholipase C  25.47 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0302  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.23 
 
 		 331 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.782983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>