27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2341 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2341  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
475 aa  996    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003888  putative phospholipase C  60.22 
 
 
442 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01777  hypothetical protein  61.59 
 
 
446 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04769  hypothetical protein  34.96 
 
 
451 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0805  sphingomyelin phosphodiesterase C  32.81 
 
 
333 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0588  sphingomyelin phosphodiesterase  32.49 
 
 
378 aa  143  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000400305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0678  sphingomyelinase C  32.49 
 
 
338 aa  143  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000870609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0644  sphingomyelinase C  32.49 
 
 
378 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0589  sphingomyelin phosphodiesterase  32.18 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0745  sphingomyelinase C  32.49 
 
 
378 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000595202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0733  sphingomyelin phosphodiesterase C  32.18 
 
 
333 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62751e-37 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0592  sphingomyelin phosphodiesterase  32.19 
 
 
333 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00930055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0708  sphingomyelin phosphodiesterase C  31.23 
 
 
333 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0110736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0568  sphingomyelin phosphodiesterase  32.48 
 
 
330 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00667723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4628  sphingomyelin phosphodiesterase C  31.23 
 
 
333 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0012241  hitchhiker  0.0000000000097666 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2061  phospholipase C  33.21 
 
 
274 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0732002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2098  phospholipase C  33.21 
 
 
274 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2544  beta-hemolysin  31.72 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2045  sphingomyelin phosphodiesterase  30.95 
 
 
318 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.664493  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2087  sphingomyelin phosphodiesterase  31.16 
 
 
318 aa  114  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213788  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  30.37 
 
 
334 aa  97.8  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1804  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.19 
 
 
363 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1111  hypothetical protein  28.44 
 
 
351 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3662  hypothetical protein  28.15 
 
 
351 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4865  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.24 
 
 
358 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03927  inositol phosphosphingolipid phospholipase C (Eurofung)  26.56 
 
 
451 aa  45.8  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.635574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.79 
 
 
808 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>