18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1804 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1804  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 363 aa  736    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1111  hypothetical protein  54.75 
 
 		 351 aa  299  6e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4865  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.49 
 
 		 358 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3662  hypothetical protein  35.6 
 
 		 351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  31.75 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2341  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.19 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003888  putative phospholipase C  36.7 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2087  sphingomyelin phosphodiesterase  28.69 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213788  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2045  sphingomyelin phosphodiesterase  29.36 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.664493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01777  hypothetical protein  26.83 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04769  hypothetical protein  30.83 
 
 		 451 aa  50.8  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3873  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.17 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.27 
 
 		 251 aa  44.3  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2061  phospholipase C  30.48 
 
 		 274 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0732002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2098  phospholipase C  30.48 
 
 		 274 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10907  hypothetical protein  25.34 
 
 		 500 aa  43.9  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.05 
 
 		 252 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.23 
 
 		 1007 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>