34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2045 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2045  sphingomyelin phosphodiesterase  100 
 
 
318 aa  656    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.664493  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2087  sphingomyelin phosphodiesterase  83.65 
 
 
318 aa  569  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213788  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4628  sphingomyelin phosphodiesterase C  48.6 
 
 
333 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0012241  hitchhiker  0.0000000000097666 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0805  sphingomyelin phosphodiesterase C  51.7 
 
 
333 aa  316  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0708  sphingomyelin phosphodiesterase C  48.91 
 
 
333 aa  315  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0110736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0733  sphingomyelin phosphodiesterase C  51.36 
 
 
333 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62751e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0589  sphingomyelin phosphodiesterase  51.36 
 
 
378 aa  315  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0644  sphingomyelinase C  51.36 
 
 
378 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0678  sphingomyelinase C  51.36 
 
 
338 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000870609  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0745  sphingomyelinase C  51.02 
 
 
378 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000595202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0588  sphingomyelin phosphodiesterase  51.02 
 
 
378 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000400305  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0592  sphingomyelin phosphodiesterase  50 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00930055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0568  sphingomyelin phosphodiesterase  45.65 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00667723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2544  beta-hemolysin  46.85 
 
 
334 aa  286  4e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2061  phospholipase C  44.65 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0732002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2098  phospholipase C  44.65 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  31.83 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01777  hypothetical protein  32.29 
 
 
446 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003888  putative phospholipase C  30.93 
 
 
442 aa  119  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2341  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
475 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04769  hypothetical protein  33.47 
 
 
451 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.81 
 
 
808 aa  56.2  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.33 
 
 
245 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1804  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.36 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.76 
 
 
255 aa  50.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4865  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.23 
 
 
358 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.67 
 
 
250 aa  50.1  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.76 
 
 
255 aa  50.1  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.51 
 
 
257 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1111  hypothetical protein  26.92 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.72 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.03 
 
 
252 aa  44.3  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.29 
 
 
644 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.81 
 
 
319 aa  43.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>