29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0115 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  100 
 
 		 334 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4628  sphingomyelin phosphodiesterase C  35.71 
 
 		 333 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0012241  hitchhiker  0.0000000000097666 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0708  sphingomyelin phosphodiesterase C  35.4 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0110736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0592  sphingomyelin phosphodiesterase  34.46 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00930055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2061  phospholipase C  34.35 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0732002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2098  phospholipase C  34.35 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2544  beta-hemolysin  33.74 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0644  sphingomyelinase C  35.53 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0589  sphingomyelin phosphodiesterase  35.22 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0678  sphingomyelinase C  34.89 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000870609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0733  sphingomyelin phosphodiesterase C  34.89 
 
 		 333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62751e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0588  sphingomyelin phosphodiesterase  35.53 
 
 		 378 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000400305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0745  sphingomyelinase C  35.33 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000595202  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0805  sphingomyelin phosphodiesterase C  35.35 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0568  sphingomyelin phosphodiesterase  33.23 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00667723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2087  sphingomyelin phosphodiesterase  33.05 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213788  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2045  sphingomyelin phosphodiesterase  32.7 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.664493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04769  hypothetical protein  31.96 
 
 		 451 aa  100  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2341  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.37 
 
 		 475 aa  97.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01777  hypothetical protein  30.07 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003888  putative phospholipase C  28.1 
 
 		 442 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1111  hypothetical protein  28.76 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1804  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.75 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2934  hypothetical protein  21.83 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.195363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6162  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0634319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.01 
 
 		 245 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04291  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  23.92 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.996404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3662  hypothetical protein  23.93 
 
 		 351 aa  42.7  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4865  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.66 
 
 		 358 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>