31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2087 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2087  sphingomyelin phosphodiesterase  100 
 
 
318 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213788  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2045  sphingomyelin phosphodiesterase  83.65 
 
 
318 aa  558  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.664493  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0592  sphingomyelin phosphodiesterase  48.79 
 
 
333 aa  317  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00930055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4628  sphingomyelin phosphodiesterase C  48.32 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0012241  hitchhiker  0.0000000000097666 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0708  sphingomyelin phosphodiesterase C  48.32 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0110736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0588  sphingomyelin phosphodiesterase  46.53 
 
 
378 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000400305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0805  sphingomyelin phosphodiesterase C  46.97 
 
 
333 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0745  sphingomyelinase C  47.11 
 
 
378 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000595202  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0733  sphingomyelin phosphodiesterase C  46.36 
 
 
333 aa  308  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62751e-37 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0589  sphingomyelin phosphodiesterase  46.53 
 
 
378 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0644  sphingomyelinase C  46.22 
 
 
378 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0678  sphingomyelinase C  46.22 
 
 
338 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000870609  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0568  sphingomyelin phosphodiesterase  44.75 
 
 
330 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00667723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2544  beta-hemolysin  47.2 
 
 
334 aa  291  9e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2098  phospholipase C  44.65 
 
 
274 aa  265  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2061  phospholipase C  44.65 
 
 
274 aa  265  5e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0732002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  33.05 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01777  hypothetical protein  31.94 
 
 
446 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003888  putative phospholipase C  30.58 
 
 
442 aa  122  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2341  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.16 
 
 
475 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04769  hypothetical protein  30.98 
 
 
451 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26 
 
 
245 aa  55.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1804  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 
363 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
250 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.18 
 
 
257 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1111  hypothetical protein  29.25 
 
 
351 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.41 
 
 
644 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.03 
 
 
252 aa  43.9  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.53 
 
 
808 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6162  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.28 
 
 
252 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0634319  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4865  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 
358 aa  42.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>