35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2544 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2544  beta-hemolysin  100 
 
 		 334 aa  695    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0592  sphingomyelin phosphodiesterase  50 
 
 		 333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00930055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4628  sphingomyelin phosphodiesterase C  50 
 
 		 333 aa  322  7e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0012241  hitchhiker  0.0000000000097666 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0568  sphingomyelin phosphodiesterase  49.38 
 
 		 330 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00667723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0708  sphingomyelin phosphodiesterase C  52.51 
 
 		 333 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0110736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0745  sphingomyelinase C  51.45 
 
 		 378 aa  318  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000595202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0588  sphingomyelin phosphodiesterase  51.8 
 
 		 378 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000400305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0644  sphingomyelinase C  51.8 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0678  sphingomyelinase C  51.8 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000870609  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0589  sphingomyelin phosphodiesterase  51.48 
 
 		 378 aa  315  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0733  sphingomyelin phosphodiesterase C  52.51 
 
 		 333 aa  315  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62751e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0805  sphingomyelin phosphodiesterase C  51.8 
 
 		 333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2061  phospholipase C  52.55 
 
 		 274 aa  298  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0732002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2098  phospholipase C  52.55 
 
 		 274 aa  298  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2087  sphingomyelin phosphodiesterase  45.22 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213788  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2045  sphingomyelin phosphodiesterase  46.85 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.664493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  33.43 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01777  hypothetical protein  31.74 
 
 		 446 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2341  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.72 
 
 		 475 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003888  putative phospholipase C  32.76 
 
 		 442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04769  hypothetical protein  28.23 
 
 		 451 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6162  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.24 
 
 		 252 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0634319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4865  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.03 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.35 
 
 		 278 aa  46.2  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32457  predicted protein  20.72 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.553212  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.76 
 
 		 278 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2562  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.84 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  25.89 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.89 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.89 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.89 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.89 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0854  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.89 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  25.89 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.89 
 
 		 253 aa  42.7  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>