33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04769 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04769  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  934    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2341  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.96 
 
 		 475 aa  276  7e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003888  putative phospholipase C  35.83 
 
 		 442 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01777  hypothetical protein  34.01 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0678  sphingomyelinase C  32.89 
 
 		 338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000870609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0733  sphingomyelin phosphodiesterase C  32.56 
 
 		 333 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62751e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0644  sphingomyelinase C  33.33 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0589  sphingomyelin phosphodiesterase  32.67 
 
 		 378 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0588  sphingomyelin phosphodiesterase  33 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000400305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4628  sphingomyelin phosphodiesterase C  31.89 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0012241  hitchhiker  0.0000000000097666 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0592  sphingomyelin phosphodiesterase  31.8 
 
 		 333 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00930055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0745  sphingomyelinase C  32.89 
 
 		 378 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000595202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0708  sphingomyelin phosphodiesterase C  31.79 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0110736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0805  sphingomyelin phosphodiesterase C  31.99 
 
 		 333 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0568  sphingomyelin phosphodiesterase  31.99 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00667723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2061  phospholipase C  34.32 
 
 		 274 aa  127  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0732002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2098  phospholipase C  34.32 
 
 		 274 aa  127  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2544  beta-hemolysin  28.91 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2045  sphingomyelin phosphodiesterase  35.86 
 
 		 318 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.664493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  31.76 
 
 		 334 aa  113  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2087  sphingomyelin phosphodiesterase  32.94 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213788  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4865  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.2 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1804  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.09 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6162  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.74 
 
 		 252 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0634319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.01 
 
 		 268 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.08 
 
 		 1007 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1111  hypothetical protein  27.62 
 
 		 351 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 		 245 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3662  hypothetical protein  28.7 
 
 		 351 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3285  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 		 363 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.03 
 
 		 250 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 		 371 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.41 
 
 		 261 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>