26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003888 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003888  putative phospholipase C  100 
 
 		 442 aa  921    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01777  hypothetical protein  83.71 
 
 		 446 aa  795    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2341  endonuclease/exonuclease/phosphatase  60.22 
 
 		 475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04769  hypothetical protein  34.99 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0733  sphingomyelin phosphodiesterase C  35.88 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62751e-37 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0805  sphingomyelin phosphodiesterase C  36.49 
 
 		 333 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0678  sphingomyelinase C  35.55 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000870609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0644  sphingomyelinase C  35.55 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.101341  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0589  sphingomyelin phosphodiesterase  35.22 
 
 		 378 aa  146  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.197228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0588  sphingomyelin phosphodiesterase  35.55 
 
 		 378 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000400305  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0745  sphingomyelinase C  35.55 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000595202  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4628  sphingomyelin phosphodiesterase C  35.74 
 
 		 333 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0012241  hitchhiker  0.0000000000097666 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0568  sphingomyelin phosphodiesterase  35.03 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00667723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0708  sphingomyelin phosphodiesterase C  35.88 
 
 		 333 aa  144  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0110736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0592  sphingomyelin phosphodiesterase  35.08 
 
 		 333 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00930055  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2098  phospholipase C  34.57 
 
 		 274 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2061  phospholipase C  34.57 
 
 		 274 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0732002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2087  sphingomyelin phosphodiesterase  30.58 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213788  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2045  sphingomyelin phosphodiesterase  30.93 
 
 		 318 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.664493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2544  beta-hemolysin  32.76 
 
 		 334 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  28.1 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1804  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.7 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.08 
 
 		 268 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.59 
 
 		 808 aa  50.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.03 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7068  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 		 1007 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332521  normal  0.746742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>