34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2934 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2934  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.195363  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0048  hypothetical protein  31.97 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00965819  normal  0.1661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3278  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2424  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.47 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123297  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.59 
 
 
248 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2631  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.91 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.363839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.59 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
257 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
257 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.78 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.59 
 
 
276 aa  52.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.43 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.91 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.48 
 
 
251 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  23.44 
 
 
334 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2515  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3655  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0227458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1385  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.91 
 
 
278 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0965983  normal  0.123654 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.38 
 
 
262 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2284  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.08 
 
 
262 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0656369  hitchhiker  0.000754964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  27.01 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4056  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.95 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1787  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.95 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.717183  normal  0.757673 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0606  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 
250 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.55 
 
 
251 aa  46.2  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.71 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.35 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.39 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2538  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.54 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.74 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3616  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.86 
 
 
287 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.94 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.11 
 
 
335 aa  43.1  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0014  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
277 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.241981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>