213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2702 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
265 aa  549  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  63.12 
 
 
266 aa  350  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.12 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.87 
 
 
269 aa  203  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.39 
 
 
282 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.51 
 
 
576 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.91 
 
 
253 aa  116  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.58 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.8 
 
 
242 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34 
 
 
242 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.8 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.34 
 
 
837 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.27 
 
 
298 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.47 
 
 
266 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.32 
 
 
328 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.32 
 
 
328 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.37 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.84 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30 
 
 
281 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.85 
 
 
242 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.38 
 
 
244 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  29.27 
 
 
245 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.77 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.81 
 
 
260 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.1 
 
 
300 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.88 
 
 
808 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.76 
 
 
591 aa  87  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.27 
 
 
289 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
639 aa  79.3  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.8 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.8 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.8 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5742  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.5 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0430039 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 
235 aa  77  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  29.35 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4612  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.41 
 
 
268 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0765415  normal  0.0123856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.48 
 
 
246 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.91 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.46 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.64 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.51 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  29.46 
 
 
639 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.78 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.48 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  28.93 
 
 
273 aa  72  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1034  hypothetical protein  27.46 
 
 
232 aa  72  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2849  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.36 
 
 
644 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00190481  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.8 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0808  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.555445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5036  aminoacyl-tRNA hydrolase  26.95 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0185176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11000  metal-dependent hydrolase  29.73 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.08 
 
 
375 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3678  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.46 
 
 
437 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.322426 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  25.6 
 
 
302 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2645  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.12 
 
 
261 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.150024  normal  0.299573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.38 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2702  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.21 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.92 
 
 
278 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.54 
 
 
250 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  31.14 
 
 
338 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  29.13 
 
 
673 aa  63.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2329  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.51 
 
 
248 aa  63.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000636938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.97 
 
 
253 aa  63.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1193  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.22 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2759  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.72 
 
 
232 aa  62.4  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429259  decreased coverage  0.00000225225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 
279 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.49 
 
 
228 aa  62.4  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.46 
 
 
232 aa  62.4  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 
226 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.2 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.76 
 
 
338 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1438  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.5 
 
 
291 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.626738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11820  metal-dependent hydrolase  29.32 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.502125  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.35 
 
 
263 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4669  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  23.79 
 
 
363 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0962  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.62 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0980  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.62 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4386  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.1 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.32 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.07 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.07 
 
 
253 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.07 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00757  predicted DNase  26.07 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00774  hypothetical protein  26.07 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.07 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1309  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
246 aa  59.7  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.226265  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0844  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.07 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3265  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.4 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.585826  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  27.38 
 
 
277 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2495  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.4 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>