12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3662 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3662  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  706    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4865  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.28 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1804  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.6 
 
 		 363 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1111  hypothetical protein  45.28 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2341  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.15 
 
 		 475 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01777  hypothetical protein  26.21 
 
 		 446 aa  50.4  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05370  phospholipase C, putative  27.48 
 
 		 529 aa  50.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003888  putative phospholipase C  24.24 
 
 		 442 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.12 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0115  phospholipase C  23.81 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.418372  normal  0.317632 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03927  inositol phosphosphingolipid phospholipase C (Eurofung)  25.96 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.635574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10907  hypothetical protein  21.52 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>