44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4928 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 375 aa  767    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4669  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  70.33 
 
 		 363 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4304  endonuclease/exonuclease/phosphatase  71.26 
 
 		 380 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1151  hypothetical protein  59.1 
 
 		 361 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12670  hypothetical protein  58.81 
 
 		 379 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.734667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3736  endonuclease/exonuclease/phosphatase  60.9 
 
 		 362 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1637  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.11 
 
 		 350 aa  92.8  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1017  metal-dependent hydrolase  24.66 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5219  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  26.34 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00354084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0029  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  25.95 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0182707 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  26.44 
 
 		 352 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.34 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5318  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.34 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0512  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.08 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516885 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4801  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.72 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5215  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.7 
 
 		 327 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5185  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  26.34 
 
 		 352 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4783  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.34 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4902  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.95 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.08 
 
 		 265 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1534  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.28 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12480  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.86 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.76 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.43 
 
 		 266 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000483065 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.2 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.18 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.62 
 
 		 837 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.76 
 
 		 244 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  26.86 
 
 		 286 aa  50.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.46 
 
 		 278 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4024  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.76 
 
 		 278 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284823  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.92 
 
 		 253 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.01 
 
 		 278 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0587  hypothetical protein  26.55 
 
 		 222 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.15 
 
 		 282 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1127  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.99 
 
 		 262 aa  46.6  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0546014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.68 
 
 		 576 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3678  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.55 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.64554  normal  0.322426 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1311  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.42 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000133914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.94 
 
 		 236 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2394  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.96 
 
 		 243 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.47 
 
 		 808 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  26.29 
 
 		 673 aa  43.5  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.29 
 
 		 283 aa  42.7  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>